Martin Krallinger

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Coautores

Alfonso ValenciaICREA Professor. Barcelona Supercomputing Center.Dirección de correo verificada de bsc.es
Florian LeitnerData Catalytics, ION Analytics, IE UniversityDirección de correo verificada de datacatalytics.com
Lynette HirschmanThe MITRE CorporationDirección de correo verificada de mitre.org
Antonio Miranda-EscaladaSenior Data Scientist, LHF LabsDirección de correo verificada de lhf.ai
Marta VillegasBarcelona Supercomputing CenterDirección de correo verificada de bsc.es
Obdulia RabalCIMA - University of NavarraDirección de correo verificada de unav.es
Salvador Lima-LópezResearch Engineer, Barcelona Supercomputing CenterDirección de correo verificada de bsc.es
Ander IntxaurrondoResearcher at the Barcelona Supercomputing CenterDirección de correo verificada de bsc.es
Eulàlia Farré-MaduellBarcelona Supercomputing CenterDirección de correo verificada de bsc.es
Luis GascoAvatureDirección de correo verificada de avature.net
Anastasios NentidisNCSR "Demokritos", GreeceDirección de correo verificada de iit.demokritos.gr
Miguel VazquezBarcelona Supercomputing Center - Spanish National HPCDirección de correo verificada de bsc.es
Aitor Gonzalez-AgirreBarcelona Supercomputing Center (BSC)Dirección de correo verificada de bsc.es
Georgios PaliourasNational Center for Scientific Research "Demokritos", Athens, GreeceDirección de correo verificada de iit.demokritos.gr
Anastasia KritharaResearcher in National Center for Scientific Research "Demokritos", Athens, GreeceDirección de correo verificada de iit.demokritos.gr
Kevin Bretonnel CohenDirector, Biomedical Text Mining, U. Colorado School of MedicineDirección de correo verificada de ucdenver.edu
Cathy WuUniversity of DelawareDirección de correo verificada de udel.edu
Cecilia ArighiUniversity of DelawareDirección de correo verificada de udel.edu
C Rodríguez-PenagosSenior Researcher at Barcelona Supercomputing CenterDirección de correo verificada de bsc.es
Darryl Estrada-ZavalaBarcelona Supercomputing CenterDirección de correo verificada de bsc.es

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Martin Krallinger

*Head of Natural Language Processing for Biomedical Information Analysis (NLP4BIA), Barcelona

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Biomedicine NLP text mining language models AI


Título Ordenar por citas Ordenar por año Ordenar por título	Citado por Citado por	Año
The CHEMDNER corpus of chemicals and drugs and its annotation principles M Krallinger, O Rabal, F Leitner, M Vazquez, D Salgado, Z Lu, R Leaman, ... Journal of cheminformatics 7, 1-17, 2015	398	2015
Overview of the protein-protein interaction annotation extraction task of BioCreative II M Krallinger, F Leitner, C Rodriguez-Penagos, A Valencia Genome biology 9, 1-19, 2008	363	2008
Overview of the BioCreative VI chemical-protein interaction Track M Krallinger, O Rabal, SA Akhondi, M Pérez Pérez, J Santamaría, ... Proceedings of the sixth BioCreative challenge evaluation workshop 1, 141-146, 2017	311	2017
Information retrieval and text mining technologies for chemistry M Krallinger, O Rabal, A Lourenco, J Oyarzabal, A Valencia Chemical reviews 117 (12), 7673-7761, 2017	307	2017
Linking genes to literature: text mining, information extraction, and retrieval applications for biology M Krallinger, A Valencia, L Hirschman Genome biology 9, 1-14, 2008	287	2008
CHEMDNER: The drugs and chemical names extraction challenge M Krallinger, F Leitner, O Rabal, M Vazquez, J Oyarzabal, A Valencia Journal of cheminformatics 7, 1-11, 2015	270	2015
Text-mining and information-retrieval services for molecular biology M Krallinger, A Valencia Genome biology 6, 1-8, 2005	264	2005
Evaluation of text-mining systems for biology: overview of the Second BioCreative community challenge M Krallinger, A Morgan, L Smith, F Leitner, L Tanabe, J Wilbur, ... Genome biology 9, 1-9, 2008	231	2008
Text-mining approaches in molecular biology and biomedicine M Krallinger, RAA Erhardt, A Valencia Drug discovery today 10 (6), 439-445, 2005	222	2005
BioC: a minimalist approach to interoperability for biomedical text processing DC Comeau, R Islamaj Doğan, P Ciccarese, KB Cohen, M Krallinger, ... Database 2013, 2013	215	2013
The Protein-Protein Interaction tasks of BioCreative III: classification/ranking of articles and linking bio-ontology concepts to full text M Krallinger, M Vazquez, F Leitner, D Salgado, A Chatr-Aryamontri, ... BMC bioinformatics 12, 1-31, 2011	200	2011
Text mining for the biocuration workflow L Hirschman, GAP Burns, M Krallinger, C Arighi, KB Cohen, A Valencia, ... Database 2012, 2012	190	2012
Evaluation of BioCreAtIvE assessment of task 2 C Blaschke, EA Leon, M Krallinger, A Valencia BMC bioinformatics 6, 1-13, 2005	188	2005
An overview of BioCreative II. 5 F Leitner, SA Mardis, M Krallinger, G Cesareni, LA Hirschman, A Valencia IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 7 (3), 385-399, 2010	149	2010
Overview of the BioCreative III workshop CN Arighi, Z Lu, M Krallinger, KB Cohen, WJ Wilbur, A Valencia, ... BMC bioinformatics 12, 1-9, 2011	134	2011
Named Entity Recognition, Concept Normalization and Clinical Coding: Overview of the Cantemist Track for Cancer Text Mining in Spanish, Corpus, Guidelines, Methods and Results. A Miranda-Escalada, E Farré, M Krallinger IberLEF@ SEPLN, 303-323, 2020	129	2020
Text mining for biology-the way forward: opinions from leading scientists RB Altman, CM Bergman, J Blake, C Blaschke, A Cohen, F Gannon, ... Genome biology 9, 1-15, 2008	129	2008
Pharmaconer: Pharmacological substances, compounds and proteins named entity recognition track A Gonzalez-Agirre, M Marimon, A Intxaurrondo, O Rabal, M Villegas, ... Proceedings of The 5th Workshop on BioNLP Open Shared Tasks, 1-10, 2019	125	2019
Text mining for metabolic pathways, signaling cascades, and protein networks R Hoffmann, M Krallinger, E Andres, J Tamames, C Blaschke, A Valencia Science's STKE 2005 (283), pe21-pe21, 2005	124	2005
Analysis of biological processes and diseases using text mining approaches M Krallinger, F Leitner, A Valencia Bioinformatics Methods in Clinical Research, 341-382, 2010	117	2010

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