Pablo Conesa Mingo

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Carlos Oscar S. Sorzano (ORCID:000...National Center of Biotechnology (CSIC)Dirección de correo verificada de cnb.csic.es
Jose Maria CarazoProfessor, Spanish National Center for Biotechnology, CNB-CSICDirección de correo verificada de cnb.csic.es
Javier VargasOptics Department, Universidad Complutense de MadridDirección de correo verificada de ucm.es
Erney Ramírez-AportelaPostdoc, National Center for Biotechnology (CNB-CSIC). Madrid. SpainDirección de correo verificada de cnb.csic.es
Roberto MeleroCSICDirección de correo verificada de cnb.csic.es
Jose Luis VilasNational Center of Biotechnology (CSIC)Dirección de correo verificada de cnb.csic.es
Jose Miguel de la Rosa TrevinSt Jude Children's Research HospitalDirección de correo verificada de scilifelab.se
David Maluenda NiubóApplied physics - UBDirección de correo verificada de ub.edu
Gomez-Blanco, JosueResearcher, ALBADirección de correo verificada de cells.es
Joaquín OtónAlba Synchrotron - CELLSDirección de correo verificada de cells.es
Yunior César Fonseca ReynaCentro Nacional de BiotecnologíaDirección de correo verificada de cnb.csic.es
Kenneth HaugbiomodalDirección de correo verificada de biomodal.com
Christoph SteinbeckFriedrich-Schiller-University JenaDirección de correo verificada de uni-jena.de
Ruben Sanchez-GarciaIE University (Spain), University of Oxford (UK)Dirección de correo verificada de stats.ox.ac.uk
Philippe Rocca-SerraUniversity of OxfordDirección de correo verificada de oerc.ox.ac.uk
Susanna-Assunta SansoneUniversity of Oxford, Academic Lead for Research Practice; Professor of Data ReadinessDirección de correo verificada de oerc.ox.ac.uk
Janna HastingsUniversity of Zurich, University of St. GallenDirección de correo verificada de uzh.ch
Mohsen KazemiData Scientist, Australian Government Department of Health and Aged CareDirección de correo verificada de health.gov.au
Federico P. de Isidro-Gomez (ORCID:...Researcher, National Center for Biotechnology (CNB-CSIC)Dirección de correo verificada de cnb.csic.es
Alejandra Gonzalez-BeltranHead of Data, UK Atomic Energy AuthorityDirección de correo verificada de ukaea.uk

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Pablo Conesa Mingo

Software engineer, National Center for Biotechnology, CSIC

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MetaboLights—an open-access general-purpose repository for metabolomics studies and associated meta-data K Haug, RM Salek, P Conesa, J Hastings, P De Matos, M Rijnbeek, ... Nucleic acids research 41 (D1), D781-D786, 2013	722	2013
Scipion: A software framework toward integration, reproducibility and validation in 3D electron microscopy JM De la Rosa-Trevin, A Quintana, L del Cano, A Zaldívar, I Foche, ... Journal of structural biology 195 (1), 93-99, 2016	577	2016
MonoRes: automatic and accurate estimation of local resolution for electron microscopy maps JL Vilas, J Gómez-Blanco, P Conesa, R Melero, JM de la Rosa-Trevín, ... Structure 26 (2), 337-344. e4, 2018	237	2018
MetaboLights: An Open‐Access Database Repository for Metabolomics Data NS Kale, K Haug, P Conesa, K Jayseelan, P Moreno, P Rocca‐Serra, ... Current Protocols in Bioinformatics, 14.13. 1-14.13. 18, 2002	195	2002
COordination of Standards in MetabOlomicS (COSMOS): facilitating integrated metabolomics data access RM Salek, S Neumann, D Schober, J Hummel, K Billiau, J Kopka, ... Metabolomics 11, 1587-1597, 2015	173	2015
Automatic local resolution-based sharpening of cryo-EM maps E Ramírez-Aportela, JL Vilas, A Glukhova, R Melero, P Conesa, ... Bioinformatics 36 (3), 765-772, 2020	139	2020
MetaboLights: towards a new COSMOS of metabolomics data management C Steinbeck, P Conesa, K Haug, T Mahendraker, M Williams, E Maguire, ... Metabolomics 8, 757-760, 2012	100	2012
DeepRes: a new deep-learning-and aspect-based local resolution method for electron-microscopy maps E Ramírez-Aportela, J Mota, P Conesa, JM Carazo, COS Sorzano IUCrJ 6 (6), 1054-1063, 2019	89	2019
Survey of the analysis of continuous conformational variability of biological macromolecules by electron microscopy COS Sorzano, A Jiménez, J Mota, JL Vilas, D Maluenda, M Martínez, ... Structural Biology and Crystallization Communications 75 (1), 19-32, 2019	69	2019
The MetaboLights repository: curation challenges in metabolomics RM Salek, K Haug, P Conesa, J Hastings, M Williams, T Mahendraker, ... Database 2013, bat029, 2013	67	2013
Continuous flexibility analysis of SARS-CoV-2 spike prefusion structures R Melero, COS Sorzano, B Foster, JL Vilas, M Martínez, R Marabini, ... IUCrJ 7 (6), 1059-1069, 2020	52	2020
FSC-Q: a CryoEM map-to-atomic model quality validation based on the local Fourier shell correlation E Ramírez-Aportela, D Maluenda, YC Fonseca, P Conesa, R Marabini, ... Nature Communications 12 (1), 42, 2021	43	2021
A survey of the use of iterative reconstruction algorithms in electron microscopy COS Sorzano, J Vargas, J Otón, JM De La Rosa-Trevín, JL Vilas, ... BioMed research international 2017 (1), 6482567, 2017	42	2017
Image processing tools for the validation of CryoEM maps COS Sorzano, JL Vilas, E Ramírez-Aportela, J Krieger, D Del Hoyo, ... Faraday Discussions 240, 210-227, 2022	36	2022
A new algorithm for high-resolution reconstruction of single particles by electron microscopy COS Sorzano, J Vargas, JM de la Rosa-Trevín, A Jiménez, D Maluenda, ... Journal of structural biology 204 (2), 329-337, 2018	35	2018
ScipionTomo: Towards cryo-electron tomography software integration, reproducibility, and validation JJ de la Morena, P Conesa, YC Fonseca, FP de Isidro-Gómez, D Herreros, ... Journal of structural biology 214 (3), 107872, 2022	33	2022
Advances in xmipp for cryo–electron microscopy: From xmipp to scipion D Strelak, A Jiménez-Moreno, JL Vilas, E Ramírez-Aportela, ... Molecules 26 (20), 6224, 2021	33	2021
Using Scipion for stream image processing at Cryo-EM facilities J Gómez-Blanco, JM de la Rosa-Trevín, R Marabini, L Del Cano, ... Journal of structural biology 204 (3), 457-463, 2018	33	2018
Algorithmic robustness to preferred orientations in single particle analysis by CryoEM COS Sorzano, D Semchonok, SC Lin, YC Lo, JL Vilas, A Jiménez-Moreno, ... Journal of Structural Biology 213 (1), 107695, 2021	29	2021
On bias, variance, overfitting, gold standard and consensus in single-particle analysis by cryo-electron microscopy COS Sorzano, A Jiménez-Moreno, D Maluenda, M Martínez, ... Biological Crystallography 78 (4), 410-423, 2022	26	2022

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