Stephan Saalfeld

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Pavel TomancakResearch Group Leader at the Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics in DresdenDirección de correo verificada de mpi-cbg.de
Stephan PreibischHHMI Janelia Research CampusDirección de correo verificada de janelia.hhmi.org
Albert CardonaMRC LMB and University of CambridgeDirección de correo verificada de mrc-lmb.cam.ac.uk
Johannes SchindelinDirección de correo verificada de wisc.edu
Mark Longair(Previously) Postdoctoral researcher, Institute of Neuroinformatics, Uni / ETH ZürichDirección de correo verificada de longair.net
Ignacio Arganda-CarrerasIkerbasque Associate Researcher at University of the Basque Country, Biofisika Institute and DIPCDirección de correo verificada de ehu.eus
Curtis RuedenUniversity of Wisconsin-MadisonDirección de correo verificada de wisc.edu
Jean-Yves TinevezInstitut Pasteur, Paris, FranceDirección de correo verificada de pasteur.fr
John BogovicHHMI Janelia Research CampusDirección de correo verificada de janelia.hhmi.org
Jan FunkeHHMI Janelia Research CampusDirección de correo verificada de janelia.hhmi.org
Philipp HanslovskyML Ops Engineer, GenentechDirección de correo verificada de gene.com
Khaled KhairySt. Jude Children's Research HospitalDirección de correo verificada de stjude.org
Andrew ChampionPostdoc, University of CambridgeDirección de correo verificada de janelia.hhmi.org
Rodney DouglasProfessor of Computational NeuroscienceDirección de correo verificada de ini.phys.ethz.ch
Casey M Schneider-MizellAllen Institute for Brain ScienceDirección de correo verificada de alleninstitute.org
Helena JamborTU Dresden (DE) & University of Applied Sciences of the Grisons (CH)Dirección de correo verificada de tu-dresden.de
Torsten RohlfingGoogle LLCDirección de correo verificada de ieee.org
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Biomedical Image Analysis Computer Vision Machine Learning


Título Ordenar por citas Ordenar por año Ordenar por título	Citado por Citado por	Año
Fiji: an open-source platform for biological-image analysis J Schindelin, I Arganda-Carreras, E Frise, V Kaynig, M Longair, T Pietzsch, ... Nature Methods 9 (7), 676-682, 2012	61392	2012
Globally optimal stitching of tiled 3D microscopic image acquisitions S Preibisch, S Saalfeld, P Tomancak Bioinformatics 25 (11), 1463-1465, 2009	2588	2009
A connectome and analysis of the adult Drosophila central brain LK Scheffer, CS Xu, M Januszewski, Z Lu, S Takemura, KJ Hayworth, ... Elife 9, e57443, 2020	1055*	2020
TrakEM2 software for neural circuit reconstruction A Cardona, S Saalfeld, J Schindelin, I Arganda-Carreras, S Preibisch, ... PLoS One 7 (6), e38011, 2012	1013	2012
A complete electron microscopy volume of the brain of adult Drosophila melanogaster Z Zheng, JS Lauritzen, E Perlman, CG Robinson, M Nichols, D Milkie, ... Cell 174 (3), 730-743. e22, 2018	912	2018
Software for bead-based registration of selective plane illumination microscopy data S Preibisch, S Saalfeld, J Schindelin, P Tomancak Nature methods 7 (6), 418-419, 2010	470	2010
An Integrated Micro- and Macroarchitectural Analysis of the Drosophila Brain by Computer-Assisted Serial Section Electron Microscopy A Cardona, S Saalfeld, S Preibisch, B Schmid, A Cheng, J Pulokas, ... PLoS Biology 8 (10), e1000502, 2010	443	2010
CATMAID: collaborative annotation toolkit for massive amounts of image data S Saalfeld, A Cardona, V Hartenstein, P Tomančák Bioinformatics 25 (15), 1984-1986, 2009	390	2009
Cortical column and whole-brain imaging with molecular contrast and nanoscale resolution R Gao, SM Asano, S Upadhyayula, I Pisarev, DE Milkie, TL Liu, V Singh, ... Science 363 (6424), eaau8302, 2019	372	2019
Whole-brain serial-section electron microscopy in larval zebrafish DGC Hildebrand, M Cicconet, RM Torres, W Choi, TM Quan, J Moon, ... Nature 545 (7654), 345-349, 2017	350	2017
Elastic volume reconstruction from series of ultra-thin microscopy sections S Saalfeld, R Fetter, A Cardona, P Tomancak Nature Methods 9 (7), 717-720, 2012	336	2012
Quantitative neuroanatomy for connectomics in Drosophila CM Schneider-Mizell, S Gerhard, M Longair, T Kazimiers, F Li, MF Zwart, ... Elife 5, e12059, 2016	326	2016
BigDataViewer: visualization and processing for large image data sets T Pietzsch, S Saalfeld, S Preibisch, P Tomancak Nature Methods 12 (6), 481-483, 2015	314	2015
Large scale image segmentation with structured loss based deep learning for connectome reconstruction J Funke, F Tschopp, W Grisaitis, A Sheridan, C Singh, S Saalfeld, ... IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence 41 (7), 1669-1680, 2018	253*	2018
Whole-cell organelle segmentation in volume electron microscopy L Heinrich, D Bennett, D Ackerman, W Park, J Bogovic, N Eckstein, ... Nature 599 (7883), 141-146, 2021	230	2021
ImgLib2—generic image processing in Java T Pietzsch, S Preibisch, P Tomančák, S Saalfeld Bioinformatics 28 (22), 3009–3011, 2012	164	2012
Robust registration of calcium images by learned contrast synthesis JA Bogovic, P Hanslovsky, A Wong, S Saalfeld 2016 IEEE 13th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 1123-1126, 2016	162	2016
As-rigid-as-possible mosaicking and serial section registration of large ssTEM datasets S Saalfeld, A Cardona, V Hartenstein, P Tomančák Bioinformatics 26 (12), i57-i63, 2010	159	2010
Systematic imaging reveals features and changing localization of mRNAs in Drosophila development H Jambor, V Surendranath, AT Kalinka, P Mejstrik, S Saalfeld, ... eLife 4, e05003, 2015	150	2015
Automatic detection of synaptic partners in a whole-brain Drosophila electron microscopy data set J Buhmann, A Sheridan, C Malin-Mayor, P Schlegel, S Gerhard, ... Nature Methods 18 (7), 771-774, 2021	136	2021

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